Historia opieki szpitalnej w Knyszynie sięga drugiej połowy XIX wieku. Pierwsza placówka lecznicza funkcjonowała w prywatnym budynku mieszkalnym i zapewniała podstawową pomoc medyczną mieszkańcom miasta oraz okolicznych miejscowości.
W latach 1910–1911 rozpoczęto budowę pierwszego stałego kompleksu szpitalnego przy ulicy Grodzieńskiej. Inwestycja ta znacząco poprawiła warunki leczenia pacjentów i była jednym z najważniejszych przedsięwzięć publicznych w ówczesnym Knyszynie.
W czasie I wojny światowej, a następnie w okresie międzywojennym, szpital funkcjonował w trudnych warunkach materialnych i organizacyjnych. Mimo ograniczonych środków zapewniał opiekę medyczną ludności cywilnej. Podczas II wojny światowej działalność placówki była podtrzymywana dzięki zaangażowaniu personelu oraz wsparciu lokalnej społeczności.
Szczególne miejsce w historii placówki zajmuje dr Edward Jelski – lekarz internista i społecznik, który od 1963 roku był związany ze szpitalem w Knyszynie. Jego zaangażowanie przyczyniło się do dynamicznej rozbudowy i modernizacji placówki w latach 60. i 70. XX wieku.
Dzięki inicjatywie dr Edwarda Jelskiego oraz pracy społecznej mieszkańców regionu powstały nowe budynki szpitalne, które znacznie podniosły standard leczenia. Jego postawa i działalność do dziś stanowią ważny element tożsamości Szpitala.
W marcu 1976 roku nastąpiło oficjalne otwarcie nowego kompleksu szpitalnego. Placówka zyskała nowoczesną jak na ówczesne czasy infrastrukturę oraz rozszerzony zakres świadczeń. W kolejnych latach następowały dalsze modernizacje i doposażenie w nowy sprzęt medyczny.
Od 2001 roku placówka funkcjonuje jako Samodzielny Publiczny Zakład Opieki Zdrowotnej im. dr Edwarda Jelskiego. Szpital systematycznie dostosowuje swoją działalność do aktualnych potrzeb zdrowotnych regionu, ze szczególnym uwzględnieniem opieki długoterminowej i pielęgnacyjnej.
Szpital w Knyszynie został włączony do ogólnopolskiego programu „Szpital Przyjazny Wojsku”, realizowanego przez Ministerstwo Obrony Narodowej.
Porozumienie w tej sprawie podpisano 20 października 2025 roku w Wojskowym Ośrodku Szkoleniowym Jeżewo (gm. Zgierz), podczas konferencji z udziałem przedstawicieli Samorządu Gminy Knyszyn, SP ZOZ-u w Knyszynie oraz Ministerstwa Obrony Narodowej.
Gminę Knyszyn reprezentowali: Krzysztof Chowański – Burmistrz Knyszyna, Zbigniew Adam Niedzielewski – Zastępca Burmistrza oraz Danuta Zawadzka – Dyrektor Samodzielnego Publicznego Zakładu Opieki Zdrowotnej w Knyszynie im. dr. Edwarda Jelskiego.